El sistema mexicano de seguridad social, luego de operar por más de seis décadas, ha conseguido proporcionar el servicio de salud para un poco más de la mitad de la población residente. Existen grandes variaciones en la cobertura geográfica y socioeconómica. Para proporcionar una cobertura más amplia, el Gobierno Federal creó el Sistema de Protección Social en Salud (SPSS) para cubrir familias de bajos ingresos. Esto se convierte en el tercer instrumento del gobierno para cubrir el cuidado de la salud, además de los dos Institutos más importantes: el Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS) y el Instituto de Seguridad y Servicios Sociales para los Trabajadores del Estado (ISSSTE). En el contexto del SPSS, el Gobierno Federal inició la iniciativa denominada Seguro Popular de Salud (SPS). El SPS ofrece atención médica, estudios clínicos y medicamentos sin costo en el punto de servicio. Hay tres principales fuentes de financiación del SPS: el Gobierno Federal, los Gobiernos Estatales y una prima con cargo a los beneficiarios en una escala móvil, proporcional a los ingresos, de acuerdo a la cual las familias de mayor ingreso pagan primas más altas y las de menor ingreso no pagan nada (programa publicado en el Diario Oficial de la Federación al inicio de cada año). La idea del SPS es cubrir la población no cubierta por las demás instituciones de salud con énfasis en enfermedades catastróficas. El objetivo es un aumento gradual de la cobertura hasta que la cobertura universal se logre en todo el territorio de México durante un período de una década. En este trabajo, discutimos la forma como se llevó a cabo el desarrollo del SPS, comenzando por el Plan Nacional de Desarrollo del 2001 al 2006. Trazamos la historia de la SPS. En este documento nos dirigimos hacia las siguientes cuestiones principales: (1) La incorporación de población sin cobertura, en gran medida pobre, ¿cambia la estructura del costo promedio del SPS? (2) ¿Depende esto de los tipos de enfermedades y condiciones médicas cubiertos? (3) ¿Afectará la implementación gradual negativamente la viabilidad del sistema? Resulta que algunas enfermedades importantes y condiciones médicas están estrechamente relacionadas con los niveles de ingreso mientras que otras no lo están. Utilizando la base de datos del Núcleo de Acopio y Análisis de Información en Salud (NAAIS 2005), aprovechamos la información sobre las diferencias en las tasas de enfermedades de población cubierta y no cubierta en cada entidad federal. Nuestro hallazgo es que la relación no se encuentra en la dirección que esperamos: La población cubierta tiene una mayor incidencia en la mayoría de las enfermedades para los datos que tenemos.